Typy_mutacji__genetyka_populacyjna.pdf

(264 KB) Pobierz
Microsoft Word - Typy mutacji, genetyka populacyjna.doc
Typy mutacji, genetyka populacyjna
Anna Wawrocka
Katedra i Zakład Genetyki Medycznej UM w Poznaniu
Û Zmiany normalnej sekwencji DNA organizmu, spowodowane błħdami w
replikacji DNA ( mutacje spontaniczne ) lub działaniem czynników chemicznych
i fizycznych ( mutacje indukowane ).
Û ZachodzĢ w zygocie, płodzie, komórkach somatycznych i rozrodczych w ciĢgu
całego Ňycia.
Û Mutacje w komórkach somatycznych nie sĢ przekazywane potomstwu, w
odróŇnieniu od mutacji w komórkach rozrodczych, które mogĢ zostaę
potomstwu przekazane.
Û Mutacje somatyczne odgrywajĢ duŇĢ role w rozwoju nowotworów u ludzi
Û Mutacje w komórkach rozrodczych mogĢ byę odziedziczone lub powstaę de
novo w procesie oogenezy lub spermatogenezy.
Û IstniejĢ systemy naprawy DNA:
- naprawa bezpoĻrednia
- naprawa z wycinaniem zasad
- naprawa z wycinaniem nukleotydów
- naprawa rekombinacyjna
Mutacje spontaniczne :
- błħdy replikacyjne
- poĻlizg replikacyjny
- powstawanie struktur trzecio- i czwartorzħdowych
Mutacje indukowane :
¦ mutageny chemiczne:
- wprowadzenie analogu zasady w miejscu wystħpowania prawidłowej
zasady w DNA
- czynniki deaminujĢce zasady w helisie DNA
- czynniki alkilujĢce – wprowadzajĢ dodatkowe grupy alkilowe lub
arylowe w nukleotydach
- czynniki interkalujĢce – płaskie czĢsteczki wnikajĢce pomiħdzy pary
zasad w podwójnej helisie; najczħĻciej mutacje typu insercji.
¦ Mutageny fizyczne:
- promieniowanie jonizujace
- promieniowanie ultrafioletowe(UV)
- ciepło
Rodzaje mutacji:
- duŇe rearanŇacje genowe
- mutacje punktowe
- mutacje transkrypcyjne
- mutacje translacyjne
- mutacje RNA
- mutacje dynamiczne
- negatywne mutacje dominujĢce
1. DuŇe rearanŇacje genowe:
- delecje – utrata czħĻci sekwencji DNA (alfa-talasemia, niedobór
hormonu wzrostu, rodzinna hipercholesterolemia, dystrofia miħĻniowa
Duchenne’a)
- duplikacje – powielenie sekwencji DNA (rodzinna hipercholesterolemia,
dystrofia miħĻniowa Duchenne’a)
- insercje – wbudowanie dodatkowej sekwencji DNA (hemofilia,
neurofibromatoza)
Dystrofia mi ħĻ niowa Duchenne’a
objawy:
- poczĢtek choroby w wieku 3-8 lat
- utrata siły miħĻniowej
- pseudo-hipertrofia miħĻni łydek (łydki gnoma)
- hiperlordoza lħdŅwiowa
- objaw Gowera – problem ze zmianĢ pozycji siedzĢcej na stojĢcĢ
Gen dystrofiny:
- znajduje siħ na ramieniu chromosomu X (chorujĢ chłopcy, którzy
otrzymujĢ zmutowany gen od zdrowych matek nosicielek)
- gen posiada 79 egzonów
- transkrypt ma długoĻę 14 kpz
- mutacje: w 60% delecja zmieniajĢca ramkħ odczytu, w rezultacie jest
brak białka o prawidłowej funkcji, natomiast w 5% jest duplikacja
jednego lub kilku egzonów. MogĢ równieŇ wystħpowaę mutacje
punktowe.
2. Mutacje punktowe:
Najczħstsze mutacje w genomie ludzkim
Typy: insercje, delecje, tranzycje (zastĢpienie zasady purynowej innĢ zasadĢ
purynowĢ lub pirymidynowej innĢ pirymidynowĢ), transwersje (zastĢpienie puryny
pirymidynĢ lub odwrotnie)
Efekt:
- mutacje missens (zmiany sensu) –zmiana nukleotydu w pierwszej lub
drugiej pozycji kodonu powoduje zmianħ kodowanego przez triplet
aminokwasu. Zmienia siħ aminokwas w białku
3689975.001.png
- mutacje neutralne (ciche) – nie powodujĢ zmiany kodowanego
aminokwasu, poniewaŇ zmiana nukleotydu nastħpuje w trzeciej pozycji
tripletu lub teŇ mutacja nie dotyczy sekwencji kodujĢcych lub z nimi
zwiĢzanych.
- typu stop kodon (nonsense), powodujĢce przesuniħcie ramki odczytu
(frameshift mutation)
Rodzinna Hipercholesterolemia
- Defekt w genie receptora dla lipoprotein o niskiej għstoĻci (LDL)
- Typy: delecje, duplikacje, mutacje punktowe modyfikujĢce strukturħ i funkcjħ
receptora
- Dziedziczenie autosomalne dominujĢce
- Efekt- hipercholesterolemia
- CzħstoĻę 1/500 osób
Objawy: ”BJAWY:
-Kħpki Ňółte na skórze powiek, łokci, kolan, dłoni,
-Łukowate zmatowienie obrzeŇy tħczówki (arcus lipoides),
-Wczesna miaŇdŇyca i powikłania sercowo- naczyniowe.
3. Mutacje transkrypcyjne – wystħpujĢ w obszarze od 5’ do poczĢtku kodonu
inicjacyjnego w sekwencji DNA (np. sekwencje TATA). Jest to miejsce
krytyczne dla inicjacji transkrypcji . Efektem tych mutacji jest spadek produkcji
białka.
4. Mutacje RNA
- zmieniajĢ prawidłowe miejsca łĢczĢce w regionie połĢczenia intronu i
eksonu
- tworzĢ nowe miejsca łĢczenia wewnĢtrz intronów lub eksonów
- w wyniku takiej mutacji moŇe powstaę niestabilne szybko degradujĢce
siħ RNA
5. Mutacje translacyjne :
- mutacje nonsens (stop) – w wyniku mutacji powstaje przedwczeĻnie
kodon terminacyjny stop, czego efektem jest białko skrócone
- mutacje zmiany ramki odczytu - delecja lub insercja w rejonie
kodujĢcym (nie bħdĢca wielokrotnoĻciĢ trzech) genu zmienia wszystkie
wystħpujĢce za mutacja kodony; nastħpuje zmiana sekwencji
aminokwasowej – zmienia siħ kodowane białko
3689975.002.png
Mutacja nonsensowa
Mutacja zmiany ramki odczytu (frameshift mutation)
6. Mutacje dynamiczne – mutacje wystħpujĢce tylko u człowieka, wykazujĢce
duŇĢ zmiennoĻę populacyjnĢ:
- mutacja polegajĢca na wzroĻcie liczby powtórzeı (3-, 4-, 12-
nukleotydowych)
- korelacja miedzy ciħŇkoĻciĢ choroby oraz wiekiem pojawienia siħ
objawów, a iloĻciĢ powtórzeı
- iloĻę powtórzeı moŇe wzrastaę w kolejnych pokoleniach
- objawy mogĢ nasilaę siħ lub wystħpowaę wczeĻniej w kolejnych
pokoleniach ( antycypacja )
- premutacja – wzrost iloĻci powtórzeı poniŇej wartoĻci granicznej – nie
powoduje wystĢpienia choroby – bezobjawowi nosiciele
Mutacje dynamiczne stanowiĢ podłoŇe molekularne 14 jednostek chorobowych i
moŇna je podzielię na dwie grupy:
-Typ I – choroby neurodegradacyjne: ch. Huntingtona, rdzeniowo-opuszkowy zanik
miħĻni, ataksje móŇdŇkowo-rdzeniowe,
3689975.003.png
-Typ II – dystrofia miotoniczna, zespół kruchego chromosomu X, upoĻledzenie
umysłowe zwiĢzane z kruchym miejscem FRAXE, ataksja Friedreicha.
Inkluzj ħ neuronalne – struktury widoczne pod mikroskopem Ļwietlnym, powstałe w
wyniku tworzenia makroagregatów białkowych.
Skutki tworzenia inkluzji białkowych:
-blokowanie transportu aksonalnego,
-zaburzenie funkcji mitochondriów
-zaburzenia transkrypcji
-zaburzenia apoptozy
Zespół łamliwego chromosomu X (FraX)
-Mutacje dynamiczna w genie FMR1 na długim ramieniu chromosomu X
-Wzrost iloĻci powtórzeı sekwencji CGG powyŇej 200
-Osoby zdrowe - do 54 powtórzeı, nosiciele bezobjawowi - do 200 powtórzeı (tzw.
premutacja )
7. Negatywne mutacje dominujĢce:
- zmutowany allel wytwarza produkt, który interferuje z produktem allelu
niezmutowanego
- geny kodujĢce białka strukturalne – geny kolagenu, elastyny
- choroby: osteogenesis imperfecta, zespół Marfana
Zespół Marfana
-Dziedziczenie autosomalne dominujĢce
-Mutacje w genie fibryliny (15q21), składnika matrix pozakomórkowej
-Opisano 366 mutacji
-Typy:
Nonsensowne
Mutacje składania RNA
Negatywne mutacje dominuj Ģ ce
Objawy:
•Nadmierny wzrost
•Długie, „pajĢkowate” koıczyny i palce
•Nadmierna wiotkoĻę stawów
•KrótkowzrocznoĻę, podwichniħcie soczewki
•Wypadanie płatka zastawki dwudzielnej, poszerzenie aorty, prowadzĢce do tħtniaka
rozwarstwiajĢcego aorty
-
GENETYKA POPULACYJNA
Û Zajmuje siħ badaniem alleli genów w populacji oraz siłami, które utrzymujĢ lub
zmieniajĢ czħstoĻę poszczególnych alleli i genotypów w populacji.
Û Pula genowa – wszystkie geny wystħpujĢce u osobników jednej populacji
Û Dem – lokalna krzyŇujĢca siħ populacja
Û Prawo Hardy’ego-Weinberga
CzħstoĻci poszczególnych genotypów w populacji
rozmnaŇajĢcego siħ płciowo, diploidalnego gatunku osiĢgajĢ
równowagħ po jednym pokoleniu losowego kojarzenia i zapłodnienia
oraz pozostajĢ stałe, chyba, Ňe cos zmienia czħstoĻę populacji.
p 2 :2pq: q 2
Zgłoś jeśli naruszono regulamin